Фамилия Кердикаеф — редкая и необычная для русского уха. Её происхождение, скорее всего, не славянское, а тюркское или арабское, с последующей адаптацией в русской среде. В основе лежит имя или прозвище, которое можно разложить на две части: «Керди» и «каеф».

Первая часть, «Керди», может восходить к тюркскому корню, означающему «вошел», «проник» или «попал». Вторая часть, «каеф», — это искажённое арабское слово «кайф» (удовольствие, наслаждение, состояние опьянения). В тюркских и кавказских языках это слово прижилось в значении «блаженство», «приятное расположение духа». Таким образом, прозвище Кердикаеф могло означать «вошедший в блаженство», «поймавший кайф» или, более прозаично, «получивший удовольствие». Не исключено, что так прозвали человека с весёлым, беззаботным нравом или того, кто любил проводить время в праздности.

Словообразовательная модель фамилии — типично русская. Суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягких и шипящих) указывает на принадлежность: «чей?» — Кердикаеф. В русской традиции так образовывали фамилии от прозвищ, имён и профессий. То есть носитель фамилии — потомок человека по прозвищу Кердикаеф.

Географически фамилия почти наверняка имеет южные корни: Поволжье (татарская среда), Северный Кавказ или Закавказье. В этих регионах арабские и тюркские заимствования в именах и прозвищах — обычное дело. Фамилия могла возникнуть в среде крещёных татар, горских народов или среди казачества, которое активно контактировало с тюркским миром. В центральных русских губерниях такая фамилия — большая редкость.

Написание «Кердикаеф» с буквой «ф» на конце — результат фонетической адаптации. В исходном слове «каеф» конечный звук мог быть глухим или произноситься как «в» в диалектах. При записи фамилии в русских документах (церковных метриках, ревизских сказках) писарь зафиксировал его на слух как «ф». Встречаются варианты «Кердикаев» и «Кердикайф», но именно форма с «ф» — самая характерная и редкая.