Фамилия Кержнер — это классический пример фамилии, образованной от названия профессии. Её основа — немецкое слово Kürschner, что означает «скорняк» или «меховщик». Так называли мастера, который выделывал шкуры и шил меховые изделия. В отличие от славянских аналогов вроде Скорняков или Кушнир, немецкий вариант закрепился именно в форме Кержнер.

Словообразовательная модель здесь простая: прозвище по роду занятий перешло в фамилию без дополнительных русских суффиксов. Такое прямое заимствование характерно для фамилий, которые оформлялись в среде немецкоязычных переселенцев или еврейского населения, говорившего на идише (где Kürsner звучало близко к «кержнер»). Фамилия не получила типичного русского окончания -ов или -ин, потому что фиксировалась в документах уже в готовом виде.

У фамилии много фонетических родственников: Киршнер, Киржнер, Кирзнер, Кушнер, Кушнир. Все они восходят к тому же источнику, но различаются диалектным произношением или адаптацией в разных языковых средах. Например, Киршнер — более точная передача немецкого Kirschner (южнонемецкий вариант), а Кушнир — украинская или польская переработка.

Любопытно, что фамилия Кержнер не связана с русским топонимом Керженец (река и старообрядческий скит). Несмотря на созвучие, корни здесь чисто профессиональные и немецкие. Встречается фамилия преимущественно среди еврейского населения бывшей черты оседлости, а также у потомков немецких колонистов в Поволжье и Причерноморье.