Фамилия Хабетов — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от распространённых фамилий на -ов от крестильных имён (Иванов, Петров), здесь основа неочевидна. Чтобы понять корень, нужно отбросить типичный русский фамильный суффикс -ов. Остаётся основа «Хабет».

Самая вероятная версия связывает фамилию с тюркскими языками. В них корень «хабет» или «хабит» может восходить к арабскому слову «хабит» (حابط) — «терпящий неудачу», «тщетный», или же к «хабиб» (حبيب) — «любимый», «друг». Разница в одну букву в арабской графике могла дать разное звучание при записи русскими писарями. Второй вариант, от «хабиб», встречается чаще и логичнее: фамилия могла образоваться от мужского имени Хабиб (через форму Хабит в диалектах) с добавлением русского суффикса принадлежности -ов. В таком случае Хабетов означает «потомок Хабиба» или «из рода Хабита».

Менее вероятна, но возможна версия от кавказских языков. В осетинском, например, есть слово «хæбæт» (хэбэт) — «кусок», «ломоть». Прозвище Хабет могли дать человеку по какой-то бытовой черте. Однако эта гипотеза слабее: фамилии от бытовых предметов в русской среде обычно оформляются суффиксом -ин (Хлебов — от хлеб, но не Хлебетов), а тюркская модель с -ов более типична.

Географически фамилия тяготеет к регионам с тюркским или кавказским населением: её носители встречаются в Дагестане, Чечне, а также среди татар. В центральной России она практически не известна. Это указывает на то, что предки Хабетовых, скорее всего, были мусульманами или крещёными инородцами, принявшими фамилию в XIX веке при переписях. Социальный статус мог быть разным — от крестьян до горских узденей (свободных общинников).

Словообразовательная модель проста: к основе «Хабет» добавили стандартный русский суффиг -ов, означающий принадлежность. Это типичная русификация нерусского имени или прозвища. Фамилия не имеет отношения к дворянским родам — в дореволюционных родословных книгах она не значится.