Фамилия Хабибулова — женская форма мужской фамилии Хабибулов, которая имеет очевидное восточное, а точнее — тюрко-мусульманское происхождение. В основе лежит арабское составное имя Хабибулла (Хабибуллах), что переводится как «любимец Аллаха» или «возлюбленный Бога». Первая часть — «хабиб» (любимый, друг), вторая — «улла» (Аллах). Это имя широко распространено у народов, исповедующих ислам: татар, башкир, народов Кавказа и Средней Азии.

Модель образования фамилии типовая для русского языка, но адаптированная к иноязычной основе. К имени Хабибулла добавили русский патронимический суффикс -ов (в женском роде — -ова). Такой способ был массовым в XIX — начале XX века, когда российские мусульмане получали фамилии по отцу: Хабибулла → сын Хабибуллы → Хабибулов. Суффикс -ов здесь не тюркский, а чисто русский, что указывает на длительное культурное взаимодействие и включение носителей фамилии в общероссийское сословное делопроизводство.

Географически фамилия Хабибулова чаще всего встречается в Татарстане, Башкортостане, а также среди татарской диаспоры в других регионах России. У башкир и татар имя Хабибулла было популярным, поэтому фамилия не редкая. Встречаются варианты написания с одной буквой «б» (Хабиулова) или через «х» в начале — это уже искажения при записи в паспортных столах.

С социальной точки зрения, предки носителей фамилии вряд ли принадлежали к высшей аристократии. Скорее всего, это были крестьяне, ремесленники или торговцы из мусульманских общин. Фамилия не несёт указания на конкретное ремесло или прозвище — она чисто патронимическая, то есть образована от имени отца. Поэтому главное, что можно сказать о предке: его звали Хабибулла, и он, вероятно, был человеком верующим, раз получил такое имя.