Фамилия Хабихужин — редкий пример, где тюркский именник скрестился с русской словообразовательной моделью, но с неожиданным суффиксом. Вместо привычного -ов или -ев основа соединилась с суффиксом -ин, который в русских фамилиях обычно указывает на принадлежность «чьему-то сыну» или «чьему-то человеку» (Петров — сын Петра, но Петрин — человек Петра). В случае Хабихужина это даёт значение «потомок Хабихужи», где вторая часть — не фамилия, а личное имя или прозвище.

Разбираем основу. Имя Хабихужа — составное, из двух корней. Первый, «Хаби», восходит к арабскому Хабиб (حبيب) — «любимый», «друг». Второй, «хужа» (худжа, ходжа) — из персидского خواجه (хваджа) — «господин», «хозяин», «наставник», в Средней Азии и Поволжье часто означало потомка пророка или просто уважаемого человека. Вместе Хабихужа — «любимый господин» или «господин, достойный любви». Такие двусоставные имена были типичны для татар, башкир и народов Средней Азии, где к имени добавляли почтительный титул.

Географически фамилия почти наверняка привязана к Волго-Уральскому региону — Татарстану, Башкортостану или Оренбуржью. Там фамилии на -ин от тюркских основ встречаются, хотя реже, чем на -ов. Возможно, предок носителя был муллой, купцом или зажиточным крестьянином — слово «хужа» намекает на определённый социальный статус, а не на простого ремесленника.

Интересная деталь: в русских метриках и переписях XIX века такие имена часто записывали на слух, поэтому возможны варианты Хабихужин, Хабихожин или даже Хабихузин (с утратой «ж»). Но именно форма с «ж» и суффиксом -ин — самая узнаваемая и, скорее всего, исходная. Фамилия не попала в массовые словари, поэтому её носители — это, вероятно, потомки одной или нескольких семей из конкретного села или города.