Первая часть фамилии происходит от арабского мужского имени Хаким, которое в переводе на русский язык означает «мудрый». Это имя считается в мусульманстве одним из 99 эпитетов Аллаха. Вторая часть - «ян» - является вариантом персидского слова «джан» - «душа». Соответственно, фамилия Хакимьян в буквальном смысле означает «мудрая душа».