Фамилия Хакимьянова происходит от мужского имени Хакимьян, которое представляет собой сложение двух арабских корней. Первая часть — Хаким (حكيم) означает «мудрый», «врач», «судья». Вторая — Ян (جان) переводится как «душа» или «жизнь». Вместе имя Хакимьян можно понять как «мудрая душа» или «живущий по справедливости». Это составное имя характерно для тюрко-мусульманской традиции, где к арабским основам добавляли персидский компонент «ян» для благозвучия и усиления смысла.

Фамилия образована по русской патронимической модели: к основе Хакимьян прибавили суффикс -ов, а затем фамилию адаптировали для женщины через окончание -а. Такой способ оформления фамилий был типичен для народов Поволжья и Урала, особенно среди башкир и татар, которые в XIX–XX веках массово получали русские фамилии при переписях и паспортизации. Суффикс -ов указывает на принадлежность: Хакимьянова — «дочь (или жена) Хакимьяна».

Географически фамилия тяготеет к Башкортостану, Татарстану и Оренбургской области. Встречается также у казахов и узбеков, но с другим окончанием (Хакимьянов). Важная деталь: в русском языке фамилия сохранила «мягкий» знак в середине (Хакимьян-), что указывает на раздельное произношение «м» и «я». Это не ошибка письма, а точная передача звучания исходного имени: ударение падает на последний слог — Хакимья́нова.

С точки зрения социальной истории, носители этой фамилии в основном были крестьянами и сельскими жителями. Имя Хакимьян давали не так часто, как простое Хаким или Хакимулла, поэтому фамилия остаётся сравнительно редкой. Встречаются два варианта написания: через «и» (Хакимьянова) и, реже, через «ы» (Хакымьянова) — второй отражает местный диалектный выговор.