Фамилия Халабуденко — характерный пример восточнославянской модели образования с уменьшительно-ласкательным суффиксом. Основа здесь — прозвище Халабуда, а суффикс -енко (в украинской традиции — «маленький», «сын», «потомок») указывает, что фамилия сформировалась в среде, где украинская ономастическая норма была ведущей. По сути, Халабуденко — это «сын Халабуды» или «маленький Халабуда».

Само прозвище Халабуда — слово с экспрессивной окраской. В украинских и южнорусских говорах «халабуда» означала шалаш, временное укрытие, лачугу, а также нечто несуразное или громоздкое. Перенос на человека мог быть двояким: либо так называли бедняка, жившего в плохом жилье (отсюда оттенок пренебрежения), либо — с иронией — человека неопрятного, небрежного в быту. Встречается и версия, что прозвище давали непоседливому, «шалашному» человеку, который не сидит на месте.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины, а также к югу России — зонам активного расселения украинских крестьян и казаков в XVIII–XIX веках. В сословном плане Халабуденко — почти наверняка крестьянская или казачья фамилия: прозвища, образованные от бытовых реалий (жильё, утварь), редко встречались у дворянства или духовенства, которые чаще брали фамилии от церковных имён или топонимов.

Интересная деталь: в отличие от фамилий на -ов/-ев, которые закрепились в великорусских землях, модель на -енко долго оставалась «полуфамилией» — прозвищем, которое передавалось по наследству, но ещё не было окончательно зафиксировано в документах. Поэтому у одного и того же человека в ревизских сказках могли записать и Халабуда, и Халабуденко, и Халабуденков (русифицированный вариант). Последняя форма встречается реже, но она существует, что говорит о контакте украинской и русской традиций.

Спорных версий у фамилии немного. Иногда корень «хала-» пытаются связать с тюркскими языками (ср. «хала» — тётя, или «халат»), но это натяжка: суффикс -буд- в слове «халабуда» имеет явное славянское звучание (ср. «буда» — строение, будка) и не даёт оснований для тюркской этимологии. Наиболее правдоподобно — чисто славянское происхождение от описания жилья или характера.