Фамилия Халченя — наглядный пример того, как суффикс может рассказать о происхождении больше, чем корень. В ней сразу бросается в глаза окончание -еня, типичное для белорусской и западнорусской ономастики. Этот суффикс (как и -ук, -юк, -ёнок) образует фамилии, которые буквально означают «сын такого-то» или «маленький, младший». То есть Халченя — это «сын Халки» или «маленький Халка». Такая модель особенно распространена на территории современной Беларуси, в Смоленской и Брянской областях, а также на востоке Польши.

Корень «Халк-» в этой фамилии — спорный и неоднозначный. Самая прямая версия: это уменьшительное от имени или прозвища. В старых русских говорах слово «халка» могло означать «горло, глотка» или «пасть» — отсюда и прозвище горластого, крикливого человека, любителя поспорить. Такие прозвища по части тела давали охотно: Губа, Нос, Зоб, Халка. В белорусском языке «халка» — это ещё и «холка» (загривок), что могло быть прозвищем крепкого, плотного человека.

Менее вероятна, но не исключена связь с тюркским словом «халк» (народ, толпа) — в таком случае прозвище могло достаться общительному или, наоборот, многодетному человеку. Однако для фамилий на -еня тюркские корни нехарактерны, поэтому версия с местным прозвищем надёжнее.

Встречаемость фамилии Халченя сосредоточена в основном в Беларуси (особенно в Минской и Гродненской областях) и в приграничных регионах России. В украинских переписях она редка. Фамилия не дворянская — скорее всего, предки носителя относились к крестьянскому или мещанскому сословию. В XIX веке носители фамилии могли быть записаны как Халченя, Халченко или Халчёнок — в зависимости от того, в какую волость попал переписчик.

Таким образом, фамилия Халченя — это типичная белорусская «патронимическая» фамилия, образованная от прозвища Халка. Прозвище, скорее всего, указывало либо на голосистый нрав, либо на крепкое телосложение предка.