Фамилия Хализаев — редкая и неоднозначная. Её основа — «хализ» — не встречается в современных русских словарях, поэтому этимология строится на догадках, и здесь важно не переборщить с версиями. Наиболее правдоподобное объяснение: фамилия образована от прозвища или мирского имени Хализ, которое могло быть фонетическим вариантом слова «холиз» (от «холить» — ухаживать, лелеять). В русских говорах слово «холить» означало «чистить, оберегать, нежить», а «холя» — уход и забота. Прозвище Холя или Холиз мог получить чистоплотный, опрятный человек или тот, кто любил наряжаться. Суффикс «-аев» указывает на модель отчества: Хализаев — потомок Хализа. В этом случае фамилия — типично русская, с корнем, который со временем изменил звучание (о перешло в а, как в просторечном «хароший»).

Вторая версия связывает фамилию с тюркскими корнями. В языках народов Кавказа и Поволжья есть слово «халис» (чистый, искренний, настоящий) — арабского происхождения. Прозвище Халис могли дать человеку за честность или верность. При переходе в русскую среду конечное «с» могло озвончиться до «з» (Хализ), а затем добавился фамильный суффикс «-аев». Эта гипотеза слабее: фамилии на «-аев» от тюркских основ чаще образуются напрямую (Халисов, Халисов), без замены звука. К тому же в русской ономастике фамилия Хализаев не фиксируется как распространённая в тюркоязычных регионах — её носители встречаются в центральной России и на Урале.

Социальный контекст фамилии типичен для крестьянской или мещанской среды: суффикс «-аев» (вариант «-ев» после шипящих и мягких согласных) в XVI–XVII веках оформлял отчества в непривилегированных слоях. Дворяне чаще получали фамилии на «-ов» от канонических имён, а здесь — прозвищная основа, что говорит о происхождении из простых сословий. Однокоренных фамилий в русском языке почти нет: Халин, Халдин идут от других корней, а Хализаев стоит особняком.

Итог: скорее всего, фамилия Хализаев — русская, образованная от прозвища Хализ (из «холить»), с утратой исходного значения. Второй вариант — тюркский заимствование, но он менее обоснован из-за редкости такой модели. География бытования узкая, и точный корень остаётся предметом спора, но это и делает фамилию ценной для локальной истории.