Фамилия Хамайдюк — редкий пример, где украинская модель образования столкнулась с неочевидной основой, которую не сразу разберёшь на слух. Если отбросить типичный украинский суффикс -юк (указывающий на потомка или ученика: «сын такого-то»), остаётся корень Хамайд-. Вот тут и начинается главная загадка.

Скорее всего, в основе лежит не славянское имя, а тюркское или арабское слово, прошедшее через украинскую народную переработку. Наиболее вероятная версия — от имени-прозвища Хамай, которое могло восходить к тюркскому «хамай» (защитник, хранитель) или к арабскому «хамид» (восхваляющий, достойный хвалы). В украинской среде конечное «д» могло озвончиться или, наоборот, отвердеть: Хамай → Хамайд → Хамайдюк. Менее вероятно, но возможно, что это украинизированная форма польской фамилии Chomajduk или Chomajdziak, где основа восходит к диалектному «chomajda» (неуклюжий человек, растяпа), но тогда фамилия носила бы прозвищный, а не патронимический характер.

Географически фамилия тяготеет к западным регионам Украины, особенно к Волыни и Подолью, где в XVI–XVIII веках активно селились татары и турки, оставляя следы в местной ономастике. Суффикс -юк чётко указывает на украинскую, а не русскую или белорусскую среду. В русских переписях фамилия встречается редко, чаще всего у потомков украинских переселенцев на Кубани или в Сибири.

Сословно носители фамилии, скорее всего, были казаками или крестьянами, так как суффикс -юк в малороссийской традиции — признак простонародного происхождения (в отличие от дворянских -ович/-евич). В документах XIX века Хамайдюки могли записываться как «малороссы» или «мещане».

Сравнение с однокоренными фамилиями (Хамай, Хамайко, Хамайлов) подтверждает, что основа не славянская, а заимствованная. Если бы корень был от «хам» (грубиян), фамилия звучала бы как Хамюк или Хамов, но наличие «ай» говорит о другой этимологии.