Фамилия Хамзатханова образована от мужского тюркского имени Хамзатхан. Первая из них восходит к имени Хамзат, которое в переводе с арабского означает «проворный». Вторая часть ведет свое начало от древнетюркского «хан» - «правитель, повелитель». Таким образом, буквально имя Хамзатхан переводится как «проворный правитель». Таким образом, потомок человека, которого звали Хамзатхан, со временем получил фамилию Хамзатханов. Однако процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому точно определить время и место происхождения рода Хамзатхановых можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований.