Фамилия Харихонова — редкий случай в русской ономастике, где женская форма закрепилась в качестве основной в словарях и базах данных, хотя по правилам мужской вариант — Харихонов. В основе фамилии лежит имя или прозвище Харихон. Это сложносоставное образование, которое можно разобрать на две части: «Хари» и «хон».

Первая часть, «Хари», — это усечённая форма от канонического имени Харитон (греч. Χαρίτων — «щедрый», «милостивый», «приносящий радость»). В народной речи имя Харитон часто сокращали до Хари, Хариша, Хариня. Вторая часть, «хон», — более загадочная. Скорее всего, это диалектный вариант слова «хонь» или «хоня» — в русских говорах так называли тихого, скромного, незлобивого человека, иногда с оттенком простоватости. В некоторых областях «хоней» могли называть и домашнее животное, например, ласково — кошку или собаку, но в прозвищах людей это слово обычно означало «тихоня». Таким образом, Харихон — это человек по имени Хари (Харитон), которого за характер прозвали «хоней»: «Хари-хоня» — Харитон-тихоня.

Суффикс -ов указывает на стандартную русскую модель образования фамилий: Харихонов — сын Харихона. Фамилия, скорее всего, возникла в среде крестьян или посадских людей, где прозвища часто строились на бытовых наблюдениях и уменьшительных формах имён. Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России — именно там диалектное слово «хоня» фиксируется в говорах, а имя Харитон было распространено. Встречается она нечасто: по данным современных телефонных справочников и баз ЗАГС, основные носители сосредоточены в Вологодской, Архангельской и Кировской областях, что подтверждает севернорусское происхождение.

Интересная деталь: в некоторых архивных записях XIX века фамилия писалась через «о» — «Хорихонов», что отражает акающее произношение (Харихон → Хорихон). Это лишний раз подтверждает, что фамилия формировалась в устной среде, а не в канцелярии. С точки зрения социальной истории, предки Харихоновых были, вероятно, государственными или помещичьими крестьянами, а возможно — и однодворцами (на юге России эта фамилия почти не встречается). В любом случае, фамилия Харихонова — живое свидетельство того, как имя и прозвище слились в одно слово, закрепив за родом память о конкретном человеке — Харитоне, которого в деревне знали как тихого и доброго парня.