Основой фамилии Харин послужило мирское имя Харя. Фамилия Харин восходит к христианскому мужскому имени Харитон (в переводе с греческого – «щедрый»). Согласно другой версии, фамилия образована от названия жителей города Харьков, который в свою очередь обязан своим названием первопоселенцу - казаку Харитону, прозванному Харько. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Харя, со временем получил фамилию Харин.