Фамилия Хионин образована от имени или прозвища Хионя. В основе, скорее всего, лежит каноническое имя Хионий (от греческого «хион» — «снег»). В русской народной среде полные церковные формы часто усекали и смягчали, добавляя суффикс -я: так из Хионий появлялся Хионя. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — Хионин, то есть потомок Хиони.

Существует и более бытовая версия: в некоторых говорах «хионить» значило «хитрить, лукавить, изворачиваться». Тогда Хионя — прозвище ловкого, ушлого человека. Но эта версия менее распространена, так как глагол редкий, а имя Хионий в святцах есть, что делает первую гипотезу надёжнее.

Фамилия нечастая, встречается в центральных областях России и в Поволжье. По сословной принадлежности предки Хиониных, скорее всего, были крестьянами или мещанами — в дворянских родословных книгах эта фамилия не значится.

Однокоренные фамилии — Хионов, Хионьев — образованы от той же основы, но с разными суффиксами. Хионин же сохранил именно «домашнюю», уменьшительную форму имени, что типично для фамилий, возникших в крестьянской среде.