Фамилия Хлопуновская звучит необычно и сразу привлекает внимание. Её основа — не имя и не профессия, а прозвище, причём весьма выразительное. В основе лежит слово «хлопун» или «хлопунья» — так в русских говорах называли непоседливого, суетливого человека, который постоянно «хлопает» (суетится, хлопочет, делает всё с шумом и спешкой). В некоторых диалектах «хлопуном» называли и того, кто громко хлопает дверьми, или даже сплетника. Таким образом, первый носитель прозвища Хлопун — скорее всего, человек живой, деятельный, возможно, излишне торопливый.

С точки зрения словообразовательной модели, фамилия прошла длинный путь. Сначала от прозвища Хлопун образовалась фамилия Хлопунов — по стандартной русской модели на -ов (чей? — сын Хлопуна). Затем к этой уже готовой фамилии добавился суффикс -ск-, характерный для дворянских, шляхетских или географических фамилий. Финаль -ая указывает на женскую форму (в русской традиции фамилии на -ский/-ская могли передаваться по мужской линии, но склоняться по-разному). То есть Хлопуновская — это, скорее всего, женский вариант фамилии Хлопуновский, а та, в свою очередь, могла означать «принадлежащий роду Хлопуновых» или «выходец из местности, где жили Хлопуновы».

Такая модель — добавление -ский к уже существующей фамилии — нечаста. Она встречается в основном у потомков, которые хотели подчеркнуть своё дворянское происхождение или получить фамилию, звучащую более «благородно», как у польской шляхты. Поэтому можно предположить, что предки Хлопуновских не были крестьянами: возможно, это обедневшие дворяне, однодворцы (особенно если фамилия бытует в южнорусских областях) или казаки. В казачьей среде такие «двойные» фамилии тоже встречались.

Географически фамилия редкая. Наибольшая концентрация носителей — в Беларуси и в западных областях России (Смоленская, Брянская), что подтверждает версию о польско-литовском влиянии на форму. Встречается она и на Украине. В центральной России, особенно в Москве, Хлопуновские — единичные случаи, скорее всего, приезжие.

Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Хлопуно́вская, хотя в разговорной речи можно услышать и Хлопу́новская. Первый вариант ближе к исходному прозвищу (хлопу́н). Фамилия склоняется как прилагательное: Хлопуновской, Хлопуновскую и так далее.