Фамилия Хлопуновский — редкий пример, где географическая привязка почти наверняка перевешивает прозвищную. Она образована по продуктивной модели на -ский, которая в XVIII–XIX веках закреплялась за польской, украинской и белорусской шляхтой, а в Российской империи — за духовенством и разночинной интеллигенцией. Суффикс -ский указывает на связь с местом: «тот, кто родом из Хлопунова» или «владелец Хлопунова». Но вот загвоздка — топоним Хлопуново или Хлопунов встречается в нескольких губерниях, и все они невелики.

Основа фамилии — прозвище Хлопун. В русских говорах «хлопун» — это и болтун, пустомеля (от «хлопать языком»), и человек, который ходит, громко хлопая дверьми или обувью. В южных и западных диалектах «хлопун» могло означать того, кто бьёт в ладоши, хлопает — например, скомороха или зазывалу. Но есть и более прозаичная версия: в польском языке chłop — «крестьянин», «мужик», и chłopun могло быть уничижительным или шутливым прозвищем. Однако для фамилии с -ский это маловероятно: такие основы обычно давали фамилии на -ов/-ев.

Гораздо правдоподобнее, что Хлопуновский — это потомок того, кто получил фамилию по названию своего имения или деревни. В ревизских сказках XIX века встречаются крестьяне и мещане Хлопуновы из Тверской и Смоленской губерний. Если предок перебрался в город или поступил в семинарию, ему могли «облагородить» фамилию, добавив -ский. В духовной среде это было обычной практикой: сын дьячка Хлопунова становился Хлопуновским при поступлении в училище.

В написании фамилии нет вариантов — только Хлопуновский. Ударение, скорее всего, падает на предпоследний слог: Хлопуно́вский, как у большинства фамилий на -овский. Встречаемость крайне низкая: по открытым данным, в России сегодня живут единицы носителей, в основном в Центральном регионе и на юге. Никаких громких исторических фигур с этой фамилией не зафиксировано — она осталась в тени, но именно это и делает её ценной для семейной истории: каждый Хлопуновский — почти наверняка потомок одного небольшого рода.