Фамилия Хныгичева — редкая и нестандартная по звучанию, что сразу наводит на мысль о прозвищном происхождении. Её основа — глагол «хныкать», то есть «плакать, ныть, жаловаться». В русских говорах, особенно южных, слово «хныга» означало плаксу, капризного или надоедливого человека. Так могли прозвать ребёнка, который часто хныкал, либо взрослого с ворчливым характером. Фамилия образована по притяжательной модели: суффикс «-ичев» указывает на принадлежность к отцу или главе семьи. Хныгичев, соответственно, — сын или потомок Хныги.

Важная деталь: в фамилии присутствует суффикс «-ичев», а не более распространённый «-ов» или «-ев». Это говорит о том, что прозвище Хныга имело окончание на мягкий согласный или на «-а»: от формы Хныга образовали отчество Хныгич, а от него — фамилию Хныгичев. Такая модель характерна для северных и центральных областей России, а также для некоторых слоёв населения, где имя или прозвище на «-а» давало отчество на «-ич». В женском роде фамилия выглядит как Хныгичева.

Второй, менее вероятный вариант: основа могла быть связана с диалектным словом «хныга» в значении «хилый, болезненный человек» или даже «скупой». Но основная версия — прозвище по поведению. В ономастических работах Б. Унбегауна и В. Никонова подобные фамилии от глаголов, обозначающих звуки или эмоции (кряхтеть, охнуть, хныкать), описываются как типичные для прозвищ, которые закреплялись за человеком в быту.

Географически фамилия Хныгичева встречается крайне редко. Основные очаги — Поволжье и юг России, где диалектная форма «хныга» была употребительна. Сословно носители могли быть крестьянами или мещанами: прозвищные фамилии редко встречались у дворянства. Со временем прозвище перестало быть обидным и превратилось в фамилию, которую сейчас носят люди, чьи предки вряд ли были плаксами — просто прозвище закрепилось за родом.