Фамилия Хныкова — женская форма фамилии Хныков, и чтобы понять её происхождение, нужно разобраться с мужским вариантом. Хныков — типичная русская фамилия, образованная по модели «прозвище + суффикс -ов». Суффикс -ов указывает на принадлежность: Хныков буквально значил «сын Хныка» или «человек из рода Хныка».

Ключ к смыслу — в основе «хнык». В русских говорах слово «хныка» (или «хнык») имело два основных значения. Первое — плаксивый, капризный человек, тот, кто постоянно хнычет. Такое прозвище могли дать ребёнку или взрослому с обидчивым, слезливым характером. Второе значение, менее известное, — диалектное название зайца (по звуку, который он издаёт, или по ассоциации с жалобным криком). В некоторых областях «хныком» называли и скупого, постоянно жалующегося на нужду человека.

Сложность в том, что фамилия могла возникнуть в разных регионах независимо. В северных и центральных губерниях (Вологодская, Костромская, Вятская) прозвище Хнык чаще относили к человеку — плаксе или нытику. В южных и западных говорах, где «хнык» — заяц, прозвище могло быть шутливым или тотемным (прозвище по животному). Какую версию считать основной — вопрос без однозначного ответа, но ономастический словарь Б. Унбегауна склоняется к первому, «человеческому» значению, как более типичному для русских прозвищ.

Сам прозвищный корень «хнык» — звукоподражательный, родственный глаголу «хныкать». Такие экспрессивные прозвища на Руси давали не столько для оскорбления, сколько для «закрепления» характерной черты: человек часто хныкал — вот и стал Хныком. Со временем прозвище перешло в фамилию, потеряв оценочную окраску.

Встречаемость фамилии Хныкова в современных базах невысока, что говорит о её относительно локальном бытовании. Среди однокоренных фамилий — Хныкин (с суффиксом -ин, тоже от прозвища Хныка) и Хнычков (от «хнычок» — уменьшительная форма). Если ваши предки носили фамилию Хныков, скорее всего, они были крестьянами или мещанами из центральной России, а родоначальник получил прозвище за свой нрав — или, в редком случае, за любовь к охоте на зайцев.