Фамилия Хныковская — редкая и показательная: она почти наверняка женская по форме, но происходит от мужской фамилии или прозвища. В русской традиции фамилии на -ская/-цкая чаще всего либо дворянские (по названию имения), либо польско-белорусские, либо искусственные — из семинарской среды. В случае с Хныковской, скорее всего, мы имеем дело с вариантом, образованным от фамилии Хныков через притяжательный суффикс, но с женским окончанием.

Разберём корень. Основа «Хнык-» восходит к глаголу «хныкать» — плакать, ныть, капризничать. В древнерусских говорах «хныка» означало плаксу, нытика. Прозвище Хнык или Хныка давали человеку с жалобным голосом, вечно недовольному или болезненному ребёнку. От этого прозвища сначала образовалась фамилия Хныков («чей?» — сын Хныка), а затем, по модели, — Хныковская. В польской ономастике суффикс -овский/-евский часто указывал на принадлежность к местности, но здесь основа не топонимическая, а личная. Поэтому версия с происхождением от прозвища более правдоподобна, чем от названия деревни (Хныково гипотетически могло существовать, но маловероятно).

Географически фамилия могла закрепиться на западе России, в Беларуси или на Украине, где суффикс -ский особенно распространён. Встречается она крайне редко: по открытым данным, носителей — единицы. Это типичная «кабинетная» фамилия, которая могла возникнуть при переписи или в документах, когда крестьянину давали фамилию по прозвищу отца, но с «благородным» окончанием. Социально предки Хныковских — скорее всего, крестьяне или мещане, получившие фамилию в XIX веке после отмены крепостного права. Никаких известных дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Любопытная деталь: фамилия Хныковская стоит в одном ряду с однокоренными Хныков, Хныкин, Хныкало. Но именно форма на -ская выделяет её — она звучит «по-пански», хотя корень сниженный, бытовой. Это типичный пример контраста между народным прозвищем и книжным суффиксом, который в XIX веке часто присваивали при выдаче паспортов или в церковных метриках. Так что ваш предок мог быть просто плаксивым мужиком, а в документах стал Хныковским — солидно и неожиданно.