Фамилия Хочеева — редкий случай, когда географическая привязка оказывается важнее этимологии. С высокой вероятностью это фамилия из числа «местных»: её основа — топоним Хочево (или Хочеево). Такие названия встречаются в нескольких областях России, например, в Белгородской и Курской. Если предки носителя фамилии происходили из села Хочево, то фамилия образована по модели «название села + суффикс -ев» и отвечала на вопрос «чей?»: «человек из Хочева» — Хочеев. Женская форма Хочеева — естественное окончание для фамилий на -ев.

Если же корень не топонимический, а прозвищный, то в основе лежит древнерусское слово «хоть» или «хотеть». В старину «хоть» означало «желание, охота», а «хочея» — человека, действующего по собственной прихоти, своевольного или капризного. Прозвище Хочей могли дать упрямому или, наоборот, очень инициативному человеку. Суффикс -ев в этом случае указывает на принадлежность: «сын Хочея». Форма Хочеева, соответственно, — «дочь или жена Хочеева».

Встречается и более прозаичная версия: от мирского имени Хоч или Хоть. Такие имена, образованные от глагола «хотеть», давали в дохристианской Руси, желая ребёнку долгой жизни или крепкого здоровья. Имя Хоч зафиксировано в новгородских берестяных грамотах, что указывает на его древность.

Фамилия нечастотная и почти не имеет известных дворянских или купеческих ветвей — это фамилия крестьянского или однодворческого происхождения, особенно если связана с южнорусскими областями. В написании возможна путаница с Хочеевым (через две «е»), но оба варианта восходят к одному корню.