Фамилия Ходжгоров — редкий случай, когда географическая основа очевиднее, чем исходное значение корня. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от названия населённого пункта Ходжгор. Такие топонимы встречаются в горных районах Кавказа и Закавказья, особенно в Карачаево-Черкесии, Кабардино-Балкарии или Северной Осетии. Часть «гор» в названии прямо указывает на горную местность (ср. осетинское «хъæд» — лес, или тюркское «хой» — овца, баран). Первая часть «ходж» может восходить к имени или прозвищу: например, к арабскому «хаджи» (паломник, совершивший хадж) в местном произношении, или к тюркскому «ходжа» (господин, наставник, богатый человек). Тогда Ходжгор — это «гора Ходжи» или «гора, где жил ходжа».

Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ов, что типично для фамилий, возникших у народов Северного Кавказа в XIX–XX веках, когда их записывали в метрики и переписи на русский лад. Суффикс -ов здесь не указывает на принадлежность отцу (как в русском «Иванов»), а служит формальным окончанием фамилии. Первоначально носитель фамилии получил прозвище или родовое имя по месту жительства — «Ходжгоров» означало «из Ходжгора», «живущий у горы Ходжгор».

Встречается также написание Ходжагоров или Ходжгоров с ударением на второй слог. Путаница в первой гласной (а/о) связана с тем, что в устной речи безударный звук редуцируется, а письменная фиксация зависела от грамотности писаря. Сравните с фамилиями Ходжаев, Ходжабеков, Ходжгорян — у них общая основа «ходжа», но разная география и способы оформления.

Сословная принадлежность носителей не определена: среди кавказских горцев фамилия могла встречаться и у крестьян-общинников, и у представителей знатных родов (узденей), если предок был уважаемым человеком — ходжой. Точных сведений о распространении фамилии сегодня нет, но её носители встречаются преимущественно в регионах Кавказа и в среде потомков переселенцев в центральной России.