Фамилия Ходжян — яркий пример того, как русская письменность адаптировала армянскую фамилию, сохранив её корни и суффиксальную модель. Основа здесь — «Ходжа», восходящая к персидскому слову خواجه (khâje), что означает «господин», «хозяин», «учитель» или «богатый купец». В тюркских языках, с которыми армяне веками соседствовали, слово «ходжа» закрепилось как почётный титул: так называли уважаемого человека, наставника, а в Османской империи — ещё и духовное лицо (имама). Таким образом, первый носитель фамилии, вероятно, был либо торговцем, либо человеком, получившим это прозвище за свою учёность или богатство.

Суффикс «-ян» — один из самых распространённых патронимических формантов в армянском языке. Он выполняет ту же роль, что и русские «-ов» / «-ев»: указывает на принадлежность к роду. Ходжян буквально означает «из рода Ходжи» или «потомок Ходжи». В отличие от русских фамилий, где суффикс часто сливается с основой, армянская модель прозрачна: корень «Ходж-» (усечённая форма от «Ходжа») плюс «-ян» даёт чёткое указание на предка. Важно, что в самой Армении фамилия могла звучать иначе — в западноармянском диалекте её писали бы как Ходжян, а в восточном, лёгшем в основу современного литературного языка, — Ходжаян, но при русификации конечная гласная основы часто отпадала.

Географически фамилия Ходжян наиболее характерна для армян, происходящих из западных областей исторической Армении (территории современной Турции), а также из армянских общин Крыма, Нахичевани-на-Дону и Ростовской области. В Российской империи армянские фамилии на «-ян» часто не склонялись по падежам, и эта особенность закрепилась в русском языке: мы говорим «книга Ходжяна», но «познакомился с Ходжяном». В отличие от фамилий на «-ов», которые меняют окончание, Ходжян в мужском роде склоняется как обычное существительное второго склонения, а в женском остаётся неизменным.

Редкий случай: в армянской ономастике встречается также вариант Ходжоян, где суффикс «-оян» указывает на родство через отца. Ходжян же — более лаконичная форма, которая могла возникнуть либо как результат сокращения при заимствовании в русский язык, либо как диалектная особенность. Среди носителей фамилии известны деятели культуры и науки, но в открытых источниках нет единого «родового гнезда» — Ходжяны рассеяны по всему постсоветскому пространству, а также в диаспорах США, Франции и Ливана, что типично для армянских фамилий, не привязанных к одному селу или городу.