Фамилия Хохоненко — характерный пример украинской модели образования фамилий на -енко. Этот суффикс, один из самых распространённых в восточнославянской ономастике, изначально имел значение «маленький» или «сын»: Хохоненко — буквально «сын (или потомок) Хохона». Сама основа прозвища Хохон вызывает вопросы, и здесь возможны две основные версии.

Первая и наиболее прямая — звукоподражательная. «Хохотать» в русском и украинском языках означает громко смеяться. Прозвище Хохон могли дать человеку с заразительным, громким смехом или весельчаку, который часто хохотал. В украинском языке есть и слово «хохоня» — смешливый человек, балагур. Эта версия выглядит наиболее естественной, если учесть, что прозвища по привычкам и манере поведения давали очень часто.

Вторая версия менее очевидная, но имеет право на существование. В некоторых говорах слово «хохон» или «хохонь» могло быть вариантом названия птицы — хохлатого жаворонка или удода (сравните с «хохол», «хохлатый»). Если так, то прозвище могло отражать внешность — человека с заметным хохолком на голове, взъерошенными волосами.

География фамилии подтверждает её украинское происхождение. Хохоненко встречается преимущественно в центральных и восточных областях Украины, а также среди потомков украинских переселенцев на Кубани и в других регионах России. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто носили крестьяне и мещане центральной России, фамилии на -енко исторически были распространены во всех сословиях украинского общества — от казацкой старшины до крестьян. Поэтому предки Хохоненко могли быть и реестровыми казаками, и свободными землепашцами.

Интересно, что фамилия Хохоненко не связана с этнонимом «хохол» (пренебрежительное название украинцев). Несмотря на внешнее сходство корня, прозвище Хохон образовано от глагола или диалектного названия птицы, а не от этнического ярлыка. Это типичный случай, когда внешняя схожесть слов вводит в заблуждение.