Фамилия Холькина образована от прозвища Холя или Холька, которое восходит к глаголу «холить» — ухаживать, заботиться, лелеять. Смысл прозвища двоякий, и в этом его интерес. С одной стороны, Холькой могли называть доброго, отзывчивого человека, который сам заботится о других. С другой — того, кто сам был окружен заботой: баловня, неженку, «холеное дитятко». Вторая версия менее вероятна, но у нее есть бытовая логика: в крестьянской среде ласковое прозвище Холя нередко давали долгожданному или единственному ребенку, которого действительно холили и лелеяли.

Словообразовательная модель проста и прозрачна. Прозвище Холька (уменьшительная форма от Холя) легло в основу фамилии, а суффикс -ин указал на принадлежность: Холькин — значит «сын Хольки», потомок человека с таким прозвищем. Женская форма Холькина — естественное грамматическое следствие, по такой же схеме образованы тысячи русских фамилий от личных прозвищ и имен.

Стоит заметить, что корень «хол-» в русских фамилиях встречается нечасто, и это делает Холькиных заметными на фоне более распространенных Ивановых или Кузнецовых. Родственные фамилии — Холин, Хольцев, Холяев — тоже редки и восходят к тем же прозвищам. В говорах слово «холя» означало не только заботу, но и довольство, приволье, сытую жизнь, поэтому прозвище могло нести и оттенок «живущий в достатке».

Точных сведений о географии фамилии и известных носителях нет, но по модели образования она типична для северных и центральных русских говоров, где глагол «холить» был в ходу. В любом случае, фамилия Холькина — редкий и выразительный след прозвища, которое говорило о человеческой теплоте, заботе или, наоборот, о том, кого эта забота избаловала.