Фамилия Храпоненкова — женская форма от Храпоненков, и её разумнее всего разбирать, отталкиваясь от мужского варианта. Это типичная фамилия восточнославянского происхождения, образованная по модели «основа + суффикс -енк(ов)». Суффикс -енко (в русской адаптации часто переходящий в -енков) характерен для украинской и южнорусской ономастики и означает «сын» или «потомок». То есть Храпоненков — буквально «сын Храпоненка», а Храпоненок — уменьшительная или «детская» форма от прозвища Храпон.

Корень здесь — «храп-». Самое прямое и прозрачное объяснение: прозвище Храпон (или Храпоня) дали человеку, который громко храпел во сне. В русских говорах слово «храп» и его производные («храпун», «храпоня») имели именно это значение. В старину бытовые прозвища по физическим особенностям или привычкам давали очень часто: они были понятны всем вокруг и не требовали пояснений. Так что предок носительницы фамилии мог быть просто известным в деревне храпуном.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с диалектным глаголом «храпонить» — в некоторых говорах это означало «хватать, цапать, жадно брать». В таком случае Храпон — прозвище жадного или хваткого человека. Однако эта версия слабее: глагол редкий и локальный, тогда как «храпеть» — общеславянское и частое слово.

Написание «Храпоненкова» (с буквой «а» в корне) — единственно верное с точки зрения этимологии. Ошибкой было бы писать «Хропоненкова» или путать с фамилией Храповицкий (от «храп» как часть конской сбруи). Никакой связи с конской упряжью у Храпоненковых нет.

Географически фамилия тяготеет к юго-западным областям России и восточной Украине — регионам, где суффикс -енко был основным патронимическим форматом. Встречается она нечасто, что говорит о сравнительно позднем закреплении (вероятно, не ранее XVII–XVIII веков) и о том, что родоначальник был крестьянином или казаком, а не дворянином: дворянские фамилии на -енков в массе своей происходят от украинской старшины, но Храпоненковы в гербовники не попали.