Фамилия Храпутских — редкий пример «застывшего» падежа, характерного для северных и сибирских говоров. Суффикс -их/-ых указывает на принадлежность к роду или дому: в старину на вопрос «чьи вы?» отвечали «Храпутских», то есть из семьи Храпутского или Храпута. Такая модель типична для Вологодчины, Архангельской области, Урала и Зауралья, где фамилии не склоняли по падежам, а закрепили в родительном или предложном падеже множественного числа.

Основа фамилии — прозвище Храпут (или Храпута). Его корень «храп» связывают с глаголом «храпеть» — издавать сильные звуки во сне. В народе так могли прозвать человека, который громко и шумно спал. В словаре В. И. Даля «храпуном» называли не только того, кто храпит, но и лошадь с тяжёлым дыханием. Прозвище не обязательно было обидным — в крестьянской среде его давали по заметной бытовой черте.

Менее вероятная, но возможная версия возводит основу к диалектному «храпут» — так в некоторых говорах называли хриплого, осипшего человека или того, кто говорил с надрывом. Встречается и производное «храпута» — задира, крикун. Связь с глаголом «храпеть» остаётся основной, поскольку она прозрачна и подтверждается однокоренными фамилиями Храпов, Храпков, Храпунов.

Фамилия Храпутских зафиксирована преимущественно в Кировской области и Пермском крае. В метрических книгах XIX века встречаются крестьяне и мещане с этой фамилией в Слободском и Орловском уездах Вятской губернии. Ономастический словарь Б. Унбегауна не упоминает эту фамилию напрямую, но относит модель на -их/-ых к числу старых севернорусских. Социально носители, скорее всего, были государственными или экономическими крестьянами, реже — мастеровыми на уральских заводах.

Итог: фамилия Храпутских образована от прозвища по физиологической особенности (громкий храп) по севернорусской модели на -ых, указывающей на принадлежность к роду. Встречается в основном на Вятке и в Прикамье.