Фамилия Хрисостомов — редкий пример русской фамилии, образованной не от имени святого, а напрямую от его прозвища или титула. В основе лежит греческое слово «хрисостомос» (χρυσόστομος) — «златоуст», то есть человек с золотыми устами, блестящий оратор. В православной традиции это устойчивое прозвание Иоанна Златоуста, одного из самых почитаемых вселенских учителей и литургистов.

Модель образования фамилии — типичная для русского семинарского ономастикона. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «Хрисостомов» буквально значит «слуга или потомок Хрисостома». В духовных училищах и академиях XVIII–XIX веков будущим священникам нередко давали «говорящие» фамилии по именам святых, церковных праздников или богословских понятий. Так появились целые гнёзда фамилий: Златоустов, Златоверхов, Преображенский, Успенский. Хрисостомов — калька с греческого, более книжная и редкая, чем русифицированный вариант Златоустов. Выбор именно греческой формы мог указывать на то, что носитель учился в духовной академии, где ценилось знание эллинистической культуры.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южным губерниям Российской империи — традиционным местам формирования духовного сословия. Встречается она нечасто: по переписям XIX века, основные кланы Хрисостомовых фиксируются в Тамбовской, Рязанской и Харьковской губерниях. Это почти наверняка потомки причетников, дьяконов или священников, получивших фамилию при поступлении в семинарию.

С точки зрения словообразовательной модели интересен суффикс -ов, а не -ский, который чаще встречается у «семинарских» фамилий (например, Хрисостомовский). Выбор -ов говорит о более ранней или более простой форме — такие фамилии могли давать не только в академии, но и в приходских училищах, где не было традиции навешивать «благородные» суффиксы. Таким образом, Хрисостомов — не псевдоним и не случайное прозвище, а осмысленное указание на духовный сан предка, зафиксированное в документах церковного ведомства.