Фамилия Худойберганов — яркий пример тюркской модели образования русских фамилий, где корень лежит не в славянском, а в восточном именослове. Вопреки ожиданиям, она не связана с русским прилагательным «худой» (тощий). Основа — составное мужское имя Худойберган, которое в переводе с узбекского и других тюркских языков означает «Бог дал» или «данный Богом». Первая часть «худо» восходит к персидскому «хода» (бог, господь), вторая — «берган» (дал, даровал). Это теофорное имя, типичное для мусульманской традиции, где ребёнка нарекали в знак благодарности Всевышнему.

Фамилия образована по стандартной для Российской империи схеме: к основе добавили русский патронимический суффикс -ов, который указывает на принадлежность («сын Худойбергана»). Таким образом, Худойберганов — не просто фамилия, а русифицированная форма отчества от восточного имени. Подобная модель встречается у многих народов Средней Азии и Поволжья, чьи фамилии оформлялись в XIX–XX веках при переписях и паспортизации.

Географически фамилия чаще всего встречается в Узбекистане, Таджикистане, а также среди тюркоязычных общин в России. Варианты написания — Худайберганов, Худайбергенов — отражают диалектные различия в произношении: в некоторых говорах «худо» звучит как «худай», что ближе к персидскому «ходай» (бог). В русской транскрипции закрепился вариант через «о», хотя этимологически точнее было бы через «а».

Редкость фамилии в том, что она сохранила двойную культурную маркировку: восточное имя, означающее божественный дар, и славянский суффикс, превративший его в наследственную фамилию. Это типичный след взаимодействия тюркских и русских традиций, когда местные имена адаптировали под имперские бюрократические нормы. Если предки носителя фамилии жили в Туркестане или Бухарском эмирате, то, скорее всего, они были узбеками или таджиками, а фамилию получили при советской паспортизации 1920–1930-х годов. Дворянского происхождения у этой фамилии нет — она народная, бытовая, и её корни уходят в простые имена, которые давали детям с пожеланием божьей милости.