Фамилия Худайберганов отвечает на вопрос «чей потомок?» — и ответ этот уходит в мусульманскую традицию именования. В основе фамилии лежит мужское личное имя Худайберган, которое представляет собой диалектный вариант более распространённого тюркского имени Худайберген. Чтобы понять смысл, достаточно разобрать имя по частям: «худай» в казахском языке означает «Аллах», а «берген» — причастие со значением «данный». Складываясь, части дают прозрачный смысл: «данный Аллахом», то есть ребёнок, которого даровал Бог.

Словообразовательная модель здесь классическая для русских фамилий, которые получали нерусские народы: к восточному имени добавили русский патронимический суффикс -ов. Так из имени Худайберган возникло отчество, а затем и фамилия Худайберганов — буквально «сын Худайбергана». Важно, что в основе лежит именно диалектная форма: в литературном казахском языке имя звучит как Худайберген, с конечным -ен, но в разговорной речи и в некоторых региональных традициях оно стягивалось до Худайберган. Эта деталь — хорошая подсказка для тех, кто ищет свои корни: предки носителя фамилии, скорее всего, происходили из среды, где говорили на казахском или близких к нему тюркских наречиях.

Такие имена с компонентом «худай» были широко распространены у казахов, а также у других тюркских народов, испытавших влияние ислама. Они несли благодарность Всевышнему и одновременно служили оберегом: считалось, что имя, напоминающее о Божьем даре, защищает ребёнка. Появление фамилии Худайберганов в русскоязычной среде — результат обычной для XIX–XX веков практики, когда при переписях и оформлении документов восточные имена русифицировали, добавляя к ним фамильные суффиксы. Так потомок человека по имени Худайберган, сам того не замечая, стал носителем фамилии, которая сегодня звучит как маркер его родословной.