Фамилия Хусаенова — яркий пример того, как личное имя превращается в родовое прозвание. В её основе лежит арабское имя Хусаен (Хусейн), которое носил внук пророка Мухаммада, второй сын Али и Фатимы. Для шиитов Хусейн — третья фигура после пророка и его отца, мученик, павший в битве при Кербеле. Однако для рядового носителя фамилии важнее не политическая история раннего ислама, а то, что имя переводится с арабского как «хороший», «добрый». Нарекая сына Хусаеном, родители вкладывали в это пожелание, чтобы он вырос отзывчивым человеком, чтобы ему сопутствовали удача и успех.

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для тюркских народов, принявших ислам: к мужскому имени Хусаен добавили русский патронимический суффикс -ов, а затем и окончание -а, указывающее на женскую линию или принадлежность семье. Так что Хусаенова буквально означает «дочь (или жена) Хусаена». Мужской вариант — Хусаенов. Интересно, что в татарской и башкирской среде это имя часто записывали иначе — Хуснулла, Хусаинов, — но форма Хусаенов закрепилась в русскоязычных документах как более точная передача тюркского произношения.

Процесс формирования таких фамилий у мусульманских народов Поволжья и Приуралья растянулся на несколько столетий. Массово они появлялись в метрических книгах и ревизских сказках в XIX веке, когда Российская империя начала унифицировать учёт населения. До этого человека называли по имени отца: скажем, Хусаен улы — «сын Хусаена». Когда эта цепочка застыла в фамилии, она потеряла связь с конкретным предком и стала передаваться по наследству.

Точное место и время возникновения конкретного рода Хусаеновых можно установить только через генеалогические изыскания — архивы, ревизские сказки, посемейные списки. Но с высокой долей уверенности можно говорить, что фамилия бытует в среде татар, башкир и отчасти казахов, где имя Хусаен было распространено веками. Встречается она и у мишарей, и у сибирских татар.

Стоит упомянуть и вариант написания с одной «с» — Хусаенова, который иногда путают с более частотной фамилией Хусаинова. Разница не только в букве: Хусаинов восходит к арабской форме Хусайн с долгим гласным, а Хусаенов — к тюркской адаптации, где звук [ай] редуцировался до [а]. Обе фамилии родственны, но ведут свои линии от разных произносительных традиций одного имени.