Фамилия Хусендинов — яркий пример того, как арабское имя, пройдя через тюркскую языковую среду, закрепилось на русской почве с помощью стандартного патронимического суффикса. Корень здесь — имя Хусендин, которое представляет собой сращение двух арабских компонентов: «Хусен» (вариант имени Хусейн, в переводе «маленький красавец», «хорошенький») и «дин» (вера, религия). Таким образом, полное значение исходного имени — «краса веры» или «благочестивый». Такая модель сложения с «дином» типична для мусульманского именника (ср. Гайнутдин, Сафиуллин).

С точки зрения словообразования, перед нами классическая русская фамилия на -ов, присоединённая к основе «Хусендин». Фамилии на -инов, вроде Хусендинов, указывают на принадлежность к роду человека по имени Хусендин: «чей?» — «Хусендинов сын», «внук Хусендина». Суффикс -ин здесь не отделяется, а входит в состав основы, что отличает эту фамилию, скажем, от Хусенова, где основа короче.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где традиционно сильна примесь тюркских народов и распространён ислам: это Татарстан, Башкортостан, а также Дагестан и Чечня. У татар и башкир имя Хусендин (Хөснетдин) — вполне традиционное, а фамилии на -ов стали массово оформляться после XVI–XVII веков при взаимодействии с русской административной системой. У народов Северного Кавказа фамилии на -ов часто фиксировались в советское время при паспортизации, поэтому у чеченцев или кумыков форма «Хусендинов» может быть результатом русификации исходной родовой фамилии.

Редкая черта этой фамилии — сохранение полного четырёхсложного звучания. В русском языке часто редуцировали длинные имена: Хусейнов, Гасанов — короче. А здесь ударение падает на третий слог (Хусенди́нов), что делает фамилию ритмически заметной и не даёт ей «съежиться» до трёх слогов. Носители фамилии могут встретить варианты написания через «а» — Хусандинов, но это уже искажение, вызванное акающим произношением при записи в паспортном столе.

Вероятно, предок носителя этой фамилии был человеком, чьё имя подчёркивало его религиозность или принадлежность к духовному сословию — муллой, учителем при мечети, либо просто уважаемым старцем, получившим такое имя при рождении. Сословно это, скорее всего, не дворянская фамилия, а крестьянская или мещанская, закреплённая в XIX — начале XX века.