Фамилия Хытина — редкий случай, когда суффикс -ин указывает не на принадлежность отцу, а на прозвище матери. В русской ономастике такие фамилии называют «матримониальными», и их заметно меньше, чем отчеств на -ов/-ев. Если перед нами Хытина, то её основа — женское прозвище или имя Хыта, а сама фамилия означает «дочь (или потомок) Хыты».

Корень хыт- в русских говорах неоднозначен. В словаре Владимира Даля зафиксирован глагол «хытить» в значении «хитить, похищать, хватать». Тогда Хыта — прозвище ловкого, хваткого человека, возможно, вора или промысловика. Но есть и другая версия: в северных диалектах «хыть» — это «хворость, немощь», а «хыткий» — «хилый, болезненный». В таком случае прозвище давали слабому или часто болеющему ребёнку. Оба значения противоположны, и без точной географической привязки носителя фамилии выбрать одно сложно.

Модель образования — суффикс -ин, типичный для кратких притяжательных прилагательных. Если бы основа была мужской (Хыта), фамилия звучала бы как Хытин. Но форма Хытина — это либо женский вариант от Хытин, либо исходная фамилия жены или вдовы, записанная в документах как «Хытина». Такой способ встречался в северных и сибирских переписях, где женщина могла быть главой двора, и её прозвище передавалось детям.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Хытин, Хытов, Хытров — показывает, что корень редкий. В отличие от Хитрова, где ясно прослеживается древнерусское «хитрый» (умелый, искусный), Хытина стоит особняком. Возможно, это искажённая запись: в старых документах буква «и» и «ы» часто путались, и фамилия могла быть записана как Хитина. Но если произношение устойчиво с твёрдым «ы», это указывает на севернорусское или уральское происхождение, где «ы» сохранялось в говорах дольше.

Известных носителей фамилии в открытых источниках почти нет. Это говорит о том, что фамилия локальная, возможно, исчезающая. Её носители, скорее всего, происходят из крестьянской среды северных губерний — Архангельской, Вологодской или Вятской. Там подобные прозвища бытовали в быту, а в метрические книги попадали редко, что и объясняет редкость фамилии сегодня.