Фамилия Кичинекова образована по самой распространённой в русском языке модели — от мужской формы на -ов через притяжательный суффикс -а, указывающий на принадлежность: «чей?» — Кичинекова, то есть жена или дочь Кичинекова. Мужской вариант, Кичинеков, в свою очередь, произошёл от прозвища или имени Кичинек. Ключ к пониманию фамилии — в основе «кичин-», которая в тюркских языках, прежде всего в хакасском и алтайском, означает «маленький», «младший», «младенец». Слово «кичиг» или «кичинек» в значении «малый», «крохотный» хорошо известно в тюркской ономастике — от него образованы многие фамилии и топонимы.

Самый вероятный сценарий: предок носителя фамилии получил прозвище Кичинек, то есть «малыш», «младшенький», — возможно, как младший сын в семье, человек невысокого роста или даже как ласковое обращение к ребёнку. Прозвище закрепилось, перешло в фамилию Кичинеков, а затем и в женскую форму Кичинекова. Географически фамилия тяготеет к Хакасии, югу Красноярского края и Туве — регионам, где тюркские языки и культура оказали сильное влияние на местную ономастику. Встречается она и у хакасов, и у русских старожилов Сибири, веками живших в соседстве с тюркскими народами.

Суффикс -ек в основе — характерный тюркский уменьшительно-ласкательный аффикс, который в русской записи превратился в «-ек» или «-ик». Поэтому Кичинек буквально значит «маленький-маленький», «крошечный». В русской фамильной системе такая основа — редкий случай прямого заимствования тюркского прозвища с сохранением его внутренней формы. В отличие от фамилий, образованных от крестильных имён (Иванов, Петров), здесь мы видим живое бытовое прозвище, которое говорило о внешности или положении в семье.

Некоторые исследователи допускают, что основа могла быть связана с диалектным русским словом «кичиться» — «важничать, зазнаваться». Но эта версия слаба: от глагола «кичиться» скорее образовалась бы фамилия Кичинов или Кичигин, а не Кичинеков с тюркским уменьшительным суффиксом. К тому же ареал фамилии (Сибирь, Хакасия) надёжно указывает на тюркское происхождение. Альтернативная гипотеза — связь с хакасским «кичі» (маленький) — лишь подтверждает основную версию.

Итак, фамилия Кичинекова с высокой вероятностью означает «принадлежащая потомку Малыша» или «из рода Маленького». Это не дворянская и не крестьянская фамилия в сословном смысле — она отражает прозвище, данное человеку в среде, где тюркский язык был повседневным. Носитель такой фамилии мог быть хакасом, алтайцем или сибирским старожилом, чьи предки говорили на одном из тюркских наречий.