Фамилия Кикимоков — редкая, но прозрачная по происхождению. В её основе лежит не христианское имя, а прозвище или мирское имя Кикимок, образованное от слова «кикимора». В восточнославянской мифологии кикимора — дух дома, болота или леса, чаще женского пола, но в народной речи слово могло использоваться и как бранное прозвище для человека — неопрятного, вздорного, суеверного или просто чудаковатого. Суффикс -ок в основе Кикимок уменьшительный или пренебрежительный: так могли называть не взрослую кикимору, а мелкого, суетливого, назойливого человека. Или же это была дразнилка для ребёнка, которого мать в шутку называла «кикиморой», а потом это закрепилось как уличное прозвище.

Фамилия образована по стандартной русской патронимической модели: к прозвищу Кикимок добавили суффикс -ов, означающий «сын Кикимока» или «из рода Кикимоковых». Такая модель в XVI–XVII веках была основной для крестьян и посадских людей центральной России, Поволжья и Севера. Кикимоковы — не дворянский род, а скорее потомки крестьян или ремесленников, получивших фамилию по уличному прозвищу предка.

Интересная деталь: в отличие от фамилий, образованных от имён святых (Иванов, Петров), Кикимоков стоит в ряду «неканонических» фамилий, которые в XIX веке нередко заменяли на более благозвучные. Сохранность такой фамилии говорит о том, что семья жила в глухой местности, где церковная администрация не настаивала на смене, или же прозвище было настолько устойчивым, что его не стеснялись. Географически фамилия встречается единично, в основном на севере европейской части России и в Сибири — в регионах, куда переселялись старообрядцы и государственные крестьяне, сохранявшие архаичный говор.

Версия о финно-угорском корне (от коми «кик» — кукушка или марийского «кики» — кричать) маловероятна: фамилия явно сложилась в русской среде, где слово «кикимора» было общеупотребительным. Таким образом, Кикимоков — живое свидетельство народной культуры, где мифологический персонаж стал основой для прозвища, а прозвище — для фамилии.