Фамилия Кикис — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение заставляет задуматься. Если вы ищете корни, первое, что бросается в глаза: фамилия не вписывается в типичные русские модели на -ов, -ин или -ский. В ней нет славянского суффикса, который указывал бы на принадлежность («чей?»). Это наводит на мысль, что Кикис — фамилия не столько русского, сколько иноязычного происхождения, но давно обрусевшая.

Скорее всего, перед нами фамилия греческого или южнославянского корня. В греческом языке слово «κύκνος» (кикнос) означает «лебедь». В диалектах или при переходе в русскую речь форма могла упроститься до «Кикис». Основа могла быть прозвищем: человека могли назвать Лебедем за белокурые волосы, плавную походку или даже за характер — гордый, отстранённый. В русской традиции фамилии на -ис (вроде Кукис, Бабис) часто встречаются у греков Приазовья или у потомков выходцев с Балкан, которые селились на юге Российской империи, в Новороссии и на Кубани.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная: литовские или латышские корни. В балтийских языках есть слово «kikis» — так могли назвать крикливого человека или того, кто издаёт резкие звуки (от глагола «kikenti» — хихикать, верещать). Но для этой гипотезы нет надёжных подтверждений, и в балтийских фамилиях окончание -is обычно указывает на именительный падеж, а не на русскую адаптацию.

Поскольку фамилия очень редкая, ареал её бытования узок. Если ваши предки — Кикисы, стоит проверить метрические книги южных губерний (Таврической, Екатеринославской, Херсонской) или записи греческих поселений. В остальной России фамилия практически не встречается, что подтверждает её локальный, «привозной» характер. Суффикса -ис в русском словообразовании нет, поэтому фамилию не «создали» от русского слова — её принесли как готовую.