Фамилия Кинжибеков — явный тюркский антропоним, и её разумнее всего разбирать не с корня, а с модели образования. Основа здесь — сложное мужское имя Кинжибек, которое состоит из двух частей. Первая часть «кинжи» восходит к тюркскому слову со значением «младший», «маленький», «последний» (ср. казахское «кенже»). Вторая часть «бек» — широко распространённый титул, означающий «господин», «князь», «правитель». В составе личных имён «бек» указывало на знатность, принадлежность к военной или родовой верхушке. Таким образом, имя Кинжибек буквально переводится как «младший бек» или «последний господин». Это типичное для кочевых обществ именование, которое давали младшему, позднему сыну в семье, подчёркивая его положение, но одновременно и наделяя его высоким статусом.

Суффикс -ов в фамилии Кинжибеков — классический русский патронимический формант, который прирастили к тюркскому имени в процессе русификации. Такая модель была массовой в XIX — начале XX века при записи в метрические книги и переписи населения. Поэтому фамилия означает «сын Кинжибека» или «потомок Кинжибека».

Географически фамилия Кинжибеков наиболее вероятна среди народов, где распространены имена с компонентом «кенже/кинжи» и «бек»: это казахи, киргизы, ногайцы, отчасти башкиры и татары. Встречается она и у каракалпаков. В российских архивах и современных справочниках носители фамилии фиксируются преимущественно в Оренбургской, Астраханской областях, в Казахстане и в республиках Северного Кавказа, где есть тюркоязычное население.

Интересная деталь, которая отличает эту фамилию от многих других на -беков: двойная основа. Если фамилии вроде Беков или Бекмуратов образованы от имени, где «бек» стоит на первой позиции, то Кинжибеков — редкий случай, когда титул оказывается в конце, а уточнение (младший, последний) — в начале. Это говорит о том, что имя было неслучайным прозвищем, а строгим порядковым именем, которое давали по старшинству детей. В среде, где старший сын мог получить имя Бек, младший становился Кинжибеком.

О социальном статусе предков судить сложно: имя с «беком» не всегда означало реальное княжеское достоинство. К XIX веку оно стало просто престижным, желанным именем, которое давали и в зажиточных, и в рядовых скотоводческих семьях. Поэтому носитель фамилии Кинжибеков с равной вероятностью может происходить как от потомка родового старшины, так и от обычного кочевника, чей отец хотел подчеркнуть значимость младшего сына.