Фамилия Кинжикеев — редкий пример, где географическое происхождение почти наверняка перевешивает все остальные версии. Её ареал чётко указывает на Среднюю Азию, а точнее — на Казахстан и Киргизию. Основа фамилии, «Кинжике», с почти стопроцентной вероятностью восходит к мужскому личному имени Кинжике (вариант — Кенжике). В тюркских языках, особенно в казахском и киргизском, это имя образовано от слова «кенже» (каз. «кiнжi») — «младший», «последний ребёнок». Таким образом, Кинжике — это ласкательно-уменьшительная форма, которую давали младшему сыну в семье. Фамилия Кинжикеев, соответственно, означает «потомок Кинжике».

Суффикс «-ев» — это адаптация тюркского патронимического суффикса к русской грамматике. В XIX–XX веках, при оформлении документов в Российской империи и СССР, многие казахские и киргизские родовые имена получали стандартные русские окончания -ов/-ев. В самой казахской среде фамилия звучала бы как Кинжикеұлы («сын Кинжике»), но для метрик и паспортов выбрали привычную форму. Модель образования здесь та же, что и у фамилий Амангельдиев, Кенжебаев, Темиргалиев — все они построены от личного имени с тюркским корнем и русским суффиксом.

Стоит отметить, что в отличие от многих русских фамилий, которые могли возникать от прозвищ или названий ремёсел, Кинжикеев — чисто патронимическая фамилия. Она не говорит о профессии предка или его внешности, а только о порядке рождения. Родоначальник, скорее всего, был самым младшим сыном, и это имя закрепилось за ним настолько прочно, что перешло к потомкам в качестве фамильного.

Встречается фамилия преимущественно в южных областях Казахстана (Жамбылская, Туркестанская) и в соседних регионах Киргизии. Из-за относительной редкости в массовых базах данных и переписях носителей немного, но по ним можно проследить миграцию: часть семей переселилась в Россию, в основном в Оренбургскую область и Татарстан, в советское время. Никаких дворянских корней или древней истории до XIX века у этой фамилии нет — это «молодая» фамилия, возникшая в эпоху массовой паспортизации, что не делает её менее ценной для истории семьи.