Фамилия Кипатов — один из тех случаев, где на первый план выходит не имя, а прозвище или даже географическая привязка. Если отбросить суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Кипата), в основе лежит личное имя или прозвище Кипат. Само слово «кипат» в русских говорах не было распространённым именем, но могло звучать как вариант более известного Киприан (разговорное Куприян, отсюда и уменьшительное Кипа). Однако есть и другая, более бытовая версия: «кипать» или «кипа» — диалектное слово, означавшее кучу, ворох, связку, а в некоторых регионах — толстый, неповоротливый человек. Прозвище Кипат могли дать либо медлительному, грузному мужчине, либо торговцу, который работал с тюками товара.

Словообразовательная модель проста: основа Кипат- + типичный русский патронимический суффикс -ов. Это значит, что фамилия оформилась в среде, где отчество или прозвище отца переходило к детям как родовое имя. Судя по отсутствию суффиксов -ин или -ский, Кипатовы — выходцы из центральной или северной России, где -ов был самым массовым способом образования фамилий у крестьян и мещан.

В ономастических справочниках фамилия не слишком частотна. Она не встречается в боярских или дворянских родословных, что указывает на её простонародное происхождение. По географии бытования Кипатовы чаще всего фиксируются в Поволжье и на Урале, особенно в Пермском крае и Кировской области. Там слово «кипа» в значении «связка, тюк» было в ходу у купцов и ремесленников, так что прозвищная версия с торговлей получает дополнительный вес.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Кипаев, Кипарин, Кипасов — показывает, что все они образованы от разных форм одного корня. Но именно Кипатов стоит особняком: суффикс -ат в основе (Кипат) встречается реже, чем -ай или -ас, и может указывать на украинское или южнорусское влияние, где такие уменьшительные формы были распространены (ср. Бородат, Горбат). Если предки носителя фамилии были из южных губерний, то Кипат могло быть ласкательным вариантом имени Ипат (Ипатий), с заменой начального И на К — обычное явление в народной речи.

Таким образом, у фамилии два равноправных пути: либо от прозвища по характеру или роду занятий (торговля тюками), либо от календарного имени через народную переделку. Обе версии укладываются в типичную картину формирования русских фамилий в XVII–XIX веках, когда прозвища и имена сливались в одно родовое обозначение.