Фамилия Киперчан — редкий случай, когда географическое происхождение почти наверняка перевешивает все прочие версии. Вопреки ожиданию, корень здесь не тюркский и не славянский, а, скорее всего, румынский или молдавский. Фамилия образована от слова «chiper» — в румынском языке это значит «красивый», «изящный», «щеголеватый». Суффикс «-чан» — характерный формант для восточно-романских фамилий, указывающий на принадлежность к месту или роду. Таким образом, Киперчан — это «тот, кто из рода Кипера» или, что проще, «сын красавца».

Вторая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование, — связь с украинским или польским диалектным словом «кипер» (от немецкого Küper — бочар, бондарь). В этом случае Киперчан могло бы означать «сын бондаря». Однако против этой гипотезы говорит активное употребление суффикса «-чан» именно в румынской ономастике — в славянских языках для подобных значений чаще использовали бы «-енко» или «-ук».

Написание фамилии устойчивое, без вариантов вроде «Киперчанов» или «Киперченко», что тоже подтверждает её неславянское происхождение. Носители фамилии встречаются в основном в Молдове, в Черновицкой и Одесской областях Украины, а также в диаспоре — в Румынии и среди молдавских общин России. Фамилия не была дворянской — её носили свободные крестьяне и ремесленники Бессарабии, где румынский язык и антропонимика переплелись со славянской культурой.