Фамилия Киргизбаева — женская форма фамилии Киргизбаев, и её разумнее рассматривать как производную от мужского варианта. В основе фамилии лежит сложносоставное имя или прозвище Киргизбай. Первая часть, «киргиз», напрямую указывает на этническую принадлежность — киргиз. Вторая часть, «бай», в тюркских языках означает «господин», «богач», «хозяин». Таким образом, Киргизбай — это «киргизский богатырь» или «киргизский господин». Такая модель образования имён (этноним + социальный статус) была распространена у многих тюркских народов, особенно у казахов, башкир, татар и самих киргизов.

Фамилия образована с помощью русского патронимического суффикса -ев, который присоединяется к основам, оканчивающимся на -й. В русской традиции фамилии на -ев/-ов фиксировали принадлежность к роду: «чей?» — «Киргизбаев», то есть сын Киргизбая. Окончание -а в женской форме указывает на то, что носительница — женщина.

Стоит отметить, что фамилия Киргизбаева — не киргизская по происхождению, а скорее казахская или башкирская. У самих киргизов фамилии с таким суффиксом — явление редкое и позднее, привнесённое русской административной системой. В Казахстане же и в Башкортостане фамилии на -ев от тюркских имён — массовое явление. Поэтому, скорее всего, предки носительницы фамилии были не киргизами, а казахами или башкирами, и имя Киргизбай им дали либо по месту жительства (вблизи киргизских степей), либо как прозвище за внешнее сходство или связь с этим народом.

Единичные случаи фамилии встречаются и у татар, но основной ареал — южный Урал (Башкортостан) и северный Казахстан. Если отталкиваться от социального контекста, то «бай» в имени говорит о зажиточности или уважении к предку. В дореволюционной России баями называли богатых скотоводов или торговцев, так что предок, давший фамилию, мог быть человеком состоятельным и влиятельным в своей общине. Сегодня фамилия нечастая, но её носительницы живут как в России, так и в Казахстане, сохраняя связь с тюркскими корнями.