Фамилия Кирюханова — женская форма от Кирюханов, а та, в свою очередь, образована от просторечного имени Кирюхан. В основе лежит каноническое имя Кирилл, которое в русской народной традиции получило множество уменьшительных и обиходных форм: Кирюха, Кирюша, Кирюня, Кирюхан. Суффикс -ан в имени Кирюхан придаёт оттенок разговорности и даже некоторой фамильярности — такие формы были распространены в крестьянской и мещанской среде XV–XVII веков. Таким образом, Кирюханов буквально означает «сын Кирюхана», то есть потомок человека, которого в быту звали Кирюханом.

Интересно, что в отличие от более частых суффиксов -ов/-ев (Кириллов, Кирюшин), вариант с -анов встречается реже. Он характерен для фамилий, образованных от имён на твёрдый согласный с помощью суффикса -ан (ср. Иван — Иванов, но Иван — Ивана — Иванов — стандартная модель; здесь же Кирюхан — Кирюханов). Географически фамилия тяготеет к центральным и северным регионам России, особенно к Вологодской, Архангельской и Костромской областям, где хорошо сохранились архаичные словообразовательные модели и где имя Кирилл исторически было очень популярно.

Ономастические словари Б. Унбегауна и В. Никонова подтверждают: фамилии на -анов от форм с суффиксом -ан — маркер древней, часто недворянской среды. Предки носительницы фамилии Кирюханова, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, а само прозвище Кирюхан могло закрепиться за человеком не только по имени, но и по характеру — так в говорах иногда называли упрямого или крикливого человека (от «кирюкать» — кричать, звать). Однако основная версия всё же остаётся патронимической, от имени.

Написание фамилии устойчивое, без вариантов вроде Кирюханнов — двойная «н» здесь не нужна, так как суффикс -ан одиночный. Встречается также мужская форма Кирюханков (с суффиксом -к-, характерным для западнорусских и белорусских земель), но Кирюханов — типично великорусский вариант. Если коротко: ваша фамилия — прямой и довольно редкий след имени Кирилл, каким его знали в русской деревне несколько веков назад.