Фамилия Кисабиев — редкая, и её происхождение неочевидно. Основная версия связывает её с тюркскими языками, где корень «киса» мог означать «отрезать», «укорачивать». В таком случае Кисабий — прозвище человека, занимавшегося стрижкой или обрезкой, возможно, скорняка или портного. Суффикс «-бий» (бей) — тюркский титул, указывающий на знатность или уважение, поэтому прозвище могло означать «господин-резак» или «почтенный закройщик». Однако «бий» могло быть и просто частью сложного имени, без социального оттенка.

Альтернативная, менее вероятная версия — происхождение от арабского имени Киса (один из вариантов имени пророка Исы в исламской традиции). Если так, то Кисабий — это Иса-бей, то есть «господин Иса». Но фамилия Кисабиев встречается преимущественно у народов Северного Кавказа, особенно у осетин, где тюркские заимствования и титулы исторически часты. Осетинские фамилии на «-биев» или «-биев» (например, Кануков, Дударов) нередко образованы от тюркских основ, что делает первую версию более обоснованной.

Фамилия образована по русской модели с патронимическим суффиксом «-ев», который присоединили к основе «Кисабий». Это типично для адаптации нерусских имён и прозвищ в XIX веке, когда осетины и другие кавказские народы массово получали фамилии по отцу. Носители фамилии Кисабиев, скорее всего, потомки человека по имени или прозвищу Кисабий, который жил в горной или предгорной местности и занимался ремеслом, связанным с обработкой кожи или ткани. Географически фамилия привязана к Северной Осетии, где и сегодня встречается в основном среди осетин-дигорцев.