Фамилия Кизимишин — пример того, как редкая форма имени, попав в русскую фамильную модель, сохранила память о пограничье культур. В её основе лежит имя Кизимиша — украинская или польская уменьшительная форма от Казимир. Это старинное составное имя славянского происхождения: первая часть восходит к «кази́ть» (портить, разрушать), вторая — к «мир» или, по другой версии, к древнему «мѣръ» (великий). То есть Казимир — «разрушающий мир» (в значении воин, сокрушитель вражеского спокойствия) или «великий в приказах».

Фамилия построена по типичной восточнославянской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Кизимишин, то есть сын или потомок Кизимиши. Такие формы (Казимишин, Каземирин) встречаются в западных областях России, где сказывалось польско-литовское влияние, и на Украине.

Есть и другая версия, хотя она менее убедительна: связь с арабским именем Казим («сдерживающий гнев, терпеливый»). В пользу славянской основы говорит другое — документальные свидетельства XVI–XVII веков. В 1593 году в грамоте Бориса Годунова среди запорожских послов упоминается старшина Кызым. Позже, в документах 1649 года, фигурирует казак Кизым Величенко, а также Богдан Кизим и Кизименко — казацкие старшины. Все эти имена одного корня с Кизимишей.

Так что фамилия Кизимишин — не случайный фонетический сбой, а звено в цепочке южнорусских и украинских прозвищ и имён на Киз-/Кыз-. Носители этой фамилии, скорее всего, происходят из казачьей или крестьянской среды, где личное имя или прозвище отца легко превращалось в родовое. Точное место возникновения фамилии сейчас установить трудно, но её корни уходят в земли, где встречались славянские, польские и тюркские влияния — Поднепровье, Запорожье или южные уезды Русского государства.