Фамилия Кизюкова — женская форма фамилии Кизюков, и её происхождение стоит искать в прозвище или имени, которое легло в основу мужского варианта. Словообразовательная модель здесь типична для русских фамилий: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), то есть Кизюков — это сын или потомок человека по прозвищу Кизюк. Сама основа «Кизюк» неочевидна, и это делает фамилию интересной для разбора.

Наиболее вероятная версия связывает Кизюка с диалектным словом «кизяк» (или «кизюк») — высушенный навоз, который использовали как топливо в южных и степных регионах. В таком случае прозвище могло относиться к человеку, который занимался заготовкой или продажей этого материала, либо жил в местности, где это было основным видом топлива. Правдоподобность этой версии подкрепляется тем, что фамилии с корнем «киз-» встречаются в южнорусских и украинских говорах, а также в среде казачества.

Менее распространённая гипотеза — связь с тюркским именем или словом, например, с казахским «кызык» (интересный, забавный) или с основой «кизил» (красный). Однако такая трактовка требует дополнительных доказательств, так как фамилия Кизюков не имеет массового распространения в Поволжье или Сибири, где тюркские влияния сильнее. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) подобные основы чаще объясняются через бытовую лексику, а не через заимствования.

География фамилии Кизюковых показывает, что она редка. Основные носители встречаются в центральных и южных областях России, а также в Казахстане, что косвенно подтверждает «топливную» версию: степные и лесостепные зоны, где кизяк был в ходу, совпадают с ареалом фамилии. Суффикс -юк в прозвище (Кизюк) характерен для украинского и южнорусского словообразования, где он придаёт уменьшительный или уничижительный оттенок. Таким образом, предок Кизюковых мог быть человеком, чьё занятие или место жительства связали с этим нехитрым, но необходимым в быту материалом.