Фамилия Клейнбург звучит не по-русски, и это верная подсказка: перед нами немецкая или еврейская (ашкеназская) фамилия, образованная от двух корней. Если разобрать её по составу, всё становится прозрачно: «клейн» (klein) по-немецки значит «маленький», а «бург» (Burg) — «крепость» или «замок». Буквально — «маленькая крепость». Это типичная топонимическая фамилия, то есть она произошла от названия места.

Скорее всего, предок носителя этой фамилии жил в местечке, деревне или городе, носившем название Клейнбург. Такие топонимы встречаются в Германии, Австрии и на исторических землях Восточной Пруссии (ныне часть России и Польши). Например, Кляйнбург (Kleinburg) существует в земле Саксония-Анхальт, а также есть несколько хуторов с похожими названиями. Человек, переселившийся оттуда, получал прозвище «Клейнбургский» или просто «из Клейнбурга», которое затем закрепилось как фамилия.

Вторая, менее распространённая версия — искусственное происхождение. В XVIII–XIX веках, когда еврейское население Центральной и Восточной Европы обязали взять постоянные фамилии, многие выбирали или получали от чиновников «красивые» немецкие названия, состоящие из двух частей. «Клейнбург» могло стать такой составной фамилией по той же модели, что и Розенберг (розовая гора) или Гольдберг (золотая гора) — только с уменьшительным «клейн». В этом случае прямая географическая привязка необязательна, фамилия просто указывала на «маленькое укрепление» как образ.

Суффикса в русском понимании у фамилии нет: она пришла в готовом немецком виде. В России её носители — это, как правило, потомки немецких колонистов (приглашённых Екатериной II) или еврейских семей из черты оседлости. Встречается фамилия редко, и её обладатели могут проследить свои корни до конкретного поселения в Германии или на западе бывшей Российской империи.