Фамилия Кликотко звучит необычно, и её происхождение, скорее всего, связано с украинским или белорусским языком. На это указывает характерный суффикс -ко, который в этих регионах часто служил для образования фамилий от прозвищ или профессий. Если бы фамилия была русской, мы бы ожидали окончание -ов или -ин, но здесь перед нами типичная модель юго-западных земель.

В основе фамилии лежит прозвище Кликот. Его могли дать человеку с громким, зычным голосом или тому, кто постоянно перекликался, звал кого-то — от глагола «кликать» (звать, кричать). В старину «кликать» могло означать не просто крик, а публичное объявление, глашатайство. Поэтому предок мог быть деревенским глашатаем или просто обладал голосом, который было слышно далеко.

Версия с украинским корнем «кликотати» (стучать, щёлкать, издавать дробный звук) менее вероятна, но возможна. В таком случае прозвище могло отражать манеру ходьбы или работы — например, стук копыт, каблуков или инструмента. Однако, учитывая, что фамилии на -ко чаще образуются от имён и прозвищ, а не от звукоподражаний, версия с «кликать» выглядит правдоподобнее.

Фамилия редкая, её географическое ядро, скорее всего, находится в западных областях Украины или в южной Беларуси. Встречаются варианты написания с одной «т» — Кликоко, но это, вероятно, искажение при переписи. Сословного барьера у фамилии не было: её мог носить и крестьянин, и казак, и мещанин — в тех краях модель на -ко была распространена во всех слоях, кроме высшей аристократии.