Фамилия Климишин — типичный пример восточнославянской модели, где основой послужило не полное, а разговорное, «домашнее» имя. В её центре лежит имя Климент, которое пришло на Русь вместе с христианством из Византии. В переводе с греческого оно означает «милостивый» (от слова «клема» — милость), хотя существует и менее распространённая версия, возводящая его к слову «виноградная лоза». Однако в народном обиходе полная форма имени использовалась редко: в быту предпочитали более короткие и ласковые варианты. Одним из них и стало имя Климиша — производная форма, образованная с помощью суффикса -иш-.

Суффикс -иш- в данном случае не нёс значения увеличительности (как, например, в слове «домище»), а выполнял функцию, близкую к уменьшительно-ласкательной, часто с оттенком просторечия. Такие формы были особенно распространены в юго-западных русских землях и на территории современной Украины, где фамилии на -ин встречаются реже, чем на -енко, но всё же имеют устойчивую традицию. Фамилия Климишин, таким образом, отвечает на вопрос «чей?»: «сын Климиши» или «потомок Климиши». Со временем притяжательное прилагательное закрепилось как родовое прозвание, потеряв прямую связь с конкретным носителем имени.

Интересно, что фамилия Климишин могла возникнуть и как вариант отчества от других народных форм того же корня — например, от Клим или Клима. Но суффикс -ишин (ср. Фомин — Фомишин, Кузьма — Кузьмишин) однозначно указывает на основу Климиша, а не на Клим или Клима. Эта деталь отличает фамилию от более распространённых Климов или Климович. По сути, Климишин — редкий «след» той живой, устной традиции имянаречения, когда полное церковное имя перекраивалось на домашний лад, а получившееся прозвище становилось фамилией целого рода.