Фамилия Кливекин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, в её основе лежит не имя, а прозвище, связанное с характером или манерой поведения. Ключ к разгадке — слово «кливиться» или «кливый», которое в некоторых русских говорах означало «упрямиться, капризничать» или, напротив, «быть ловким, смышлёным». То есть прозвище Кливека мог получить либо человек с тяжёлым нравом, либо, наоборот, расторопный и хитрый.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — Кливекин. Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ и имён на -а, -я. Если бы основой было слово «кливек» без окончания, мы бы увидели суффикс -ов (Кливеков). А форма на -ин здесь выдает именно прозвищное происхождение.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с диалектным словом «кливец» — так в некоторых местах называли крюк или багор, которым вытаскивали сети. Тогда прозвище могло относиться к рыбаку или человеку, работавшему с подобными орудиями. Однако эта гипотеза слабее, так как слово «кливец» известно в узких регионах, а «кливиться» встречается шире.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России, где такие говоры были распространены. Встретить её можно в Вологодской, Костромской, Кировской областях, но нигде она не образует больших гнёзд.

Среди однокоренных фамилий — Кливин, Кливец, Кливиков. Все они восходят к тому же корню, но различаются суффиксами, что говорит о независимом образовании в разных семьях. Кливекин — одна из тех фамилий, которые не попали в массовые списки дворянских или купеческих родов, её носители, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками.