Фамилия Клокатова — женская форма мужской фамилии Клокатов, и её основа та же, что и у исходного прозвища. В центре внимания здесь не суффикс (стандартный -ов, указывающий на принадлежность: «чей?» — сын Клоката), а само слово «клокат». В русских говорах так называли человека с клоками — нечёсаными, спутанными волосами или клочковатой бородой. Прозвище могли дать за неряшливый вид, торчащие в разные стороны пряди, а иногда — иронично, за пышную, но неопрятную шевелюру.

Суффикс -ат- в основе — типичный для древнерусских прилагательных со значением «обладающий признаком»: ср. «бородатый» (с бородой), «горбатый» (с горбом). Клокатый, соответственно, «с клочьями». Такая модель прозвищ встречается реже, чем простые односложные клички, и делает фамилию более выразительной — она не просто констатирует качество, а рисует образ.

Точная география фамилии не привязана к одному региону, но корень «клок» особенно живуч в северных и сибирских говорах, где «клокать» означало также «стучать, щёлкать» (например, клювом). Впрочем, для объяснения фамилии эта версия менее вероятна: прозвище Клокат скорее связано с внешностью, чем со звуком.

Другие гипотезы — например, от диалектного «клок» (комок, кусок земли или шерсти) — не противоречат основной: прозвище мог получить и косматый человек, и тот, кто работал с клочьями шерсти (валяльщик, шерстобит). Но без дополнительных данных выбирать между этими смыслами трудно, да и не нужно. Ясно одно: предок носительницы фамилии был человеком приметным — либо из-за шевелюры, либо из-за профессии, оставившей след в прозвище.